数学科学系是黄淮学院成立最早的教学系之一，具有优良的办学传统，治学严谨，管理规范，作风朴实，师资力量雄厚，教学设施齐全，注重教育理念和办学特色，教育教学质量上乘。该系现有专任教师34人，其中教授8人，副教授10人；博士4人，硕士13人，另有兼职教授6人。1984年以来，该系教师发表学术论文400余篇，出版著作30多部，完成市厅级以上科研项目30多项，荣获市厅级以上科研奖励40多项，先后有三位教师荣获全国曾宪梓教育基金优秀教师奖，师生曾数十次在省级以上重大教学竞赛中获奖。截止2009年该系共向社会输送合格毕业生4000多名，他们中多数已成为各级学校的教学骨干，数十人荣膺省、市级劳动模范、优秀教师、新长征突击手和先进教育工作者。该系现设有理学和教育学两个学科门类的三个本科专业：数学与应用数学本科专业，信息与计算科学本科专业，小学教育（数学方向）本科专业。其中数学与应用数学专业是黄淮学院2004年首批招生的五个本科专业之一，当年招生103人，2009年毕业时37人考取了研究生。2010年毕业时41人考取了研究生。